Men det var ikke kun kvalifikationen der blev aflyst, også den ene af dagens fri træninger blev aflyst på grund af regnvejret.
Da man ikke kunne gennemføre kvalifikationen, bliver startrækkefølgen til løbet i stedet baseret på kørernes placeringer i mesterskabet.
Startrækkefølge på Twin Ring Motegi:
 |
Plac. | # | Kører | Team |
 |
1. | 3 | Helio Castroneves | Marlboro Team Penske |
2. | 9 | Scott Dixon | Target Chip Ganassi Racing |
3. | 10 | Dan Wheldon | Target Chip Ganassi Racing |
 |
4. | 6 | Sam Hornish Jr. | Marlboro Team Penske |
5. | 11 | Tony Kanaan | Andretti Green Racing |
6. | 55 | Kosuke Matsuura | Super Aguri Fernandez Racing |
 |
7. | 7 | Bryan Herta | Andretti Green Racing |
8. | 8 | Scott Sharp | Delphi Fernandez Racing |
9. | 14 | Felipe Giaffone | A.J. Foyt Enterprises |
 |
10. | 27 | Dario Franchitti | Andretti Green Racing |
11. | 4 | Vitor Meira | Panther Racing |
12. | 2 | Tomas Scheckter | Vision Racing |
 |
13. | 51 | Tomas Enge | Cheever Racing |
14. | 16 | Danica Patrick | Rahal Letterman Racing |
15. | 5 | Buddy Lazier | Dreyer & Reinbold Racing |
 |
16. | 91 | P.J. Chesson | Hemelgarn Racing |
17. | 26 | Marco Andretti | Andretti Green Racing |
18. | 15 | Buddy Rice | Rahal Letterman Racing |
 |
19. | 20 | Ed Carpenter | Vision Racing |
20. | 17 | Jeff Simmons | Rahal Letterman Racing |
 |
Hr. Nielsen
 Læs mere om: 22/04/06 - Motegi - IndyCar Series |