Det var en begivenhedsrig kvalifikation på den japanske Suzuka bane. Desværre var begivenhederne af negativ karakter. Mark Webber deltog ikke, da hans bil ikke var klar efter hans afkørsel i den 3. fri træning. Derudover blev kvalifikationen afbrudt ikke færre end 3 gange på ulykker. Værst gik det udover Timo Glock i Toyota, som måtte en tur på hospitalet efterfølgende.
Sebastian Vettel sikrede sig sin fjerde pole position i denne sæson, da han var hurtigst på Suzuka banen i Japan. Jarno Trulli var næsthurtigste og bevarede dermed sit momentum fra den 3. fri træning. På tredjepladsen kom Lewis Hamilton i McLaren.
Desværre blev kvalifikationen præget af uheldige omstændigheder. Mark Webber kunne ikke stille start på grund af en smadret racer. Heikki Kovalainen præsterede at køre af i samme sving to gange - henholdsvis i Q1 og Q3. Sebastien Buemi formåede også at køre af banen 2 gange. Sidste gang var dog efter at han havde passeret det ternede flag i Q2, men kunne ikke deltage i Q3.
Jaime Alguersuari i Toro Rosso fulgte teamkollegaens eksempel og kørte også af. Endda i samme sving. Værst gik det udover Timo Glock, som i banens sidste sving kørte galt. Det der umiddelbart lignede kraftig understyring, bragte Timo Glock af banen og i en voldsom kollision med afspærringen. Han blev bragt til banens medical center liggende på en båre. Efterfølgende blev han bragt til et nærliggende hospital til nærmere undersøgelse. De seneste oplysninger siger at han har slået ryggen kraftigt og at han har adskillige snitsår på det ene ben.
Efter kvalifikationen er det kommet frem at mindst 5 kørere skal stå skoleret for ikke at overholde reglementet om overhaling i gul flagzone. Der kan påregnes straffe hvilket så betyder en ændret startopstilling i forhold til de tider som kørerne har kvalificeret sig på.